Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms