Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms