Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms