Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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