Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcdP82347 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcdP82347 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms