Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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