Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms