Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cacng7P62956 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms