Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RhobP62746 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhobP62746 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhobP62746 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms