Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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