Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Strn4P58404 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms