Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mmp20P57748 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp20P57748 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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