Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Psen1P49769 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psen1P49769 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psen1P49769 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms