Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms