Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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LtbP41155 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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