Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VhlP40338 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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