Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms