Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp4P35123 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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