Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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