Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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NdnP25233 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NdnP25233 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms