Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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