Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18530 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms