Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms