Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms