Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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