Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CopeO89079 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms