Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lhx8O35652 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms