Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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