Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CckarO08786 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CckarO08786 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CckarO08786 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms