Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms