Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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