Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3727J3QM54 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms