Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17535J3KMR8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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