Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r34G3XA52 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms