Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zkscan2G3X952 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms