Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmgcF6VRN1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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