Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Lmod3E9QA62 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmod3E9QA62 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmod3E9QA62 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmod3E9QA62 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmod3E9QA62 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lmod3E9QA62 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms