Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms