Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx60E9PZQ1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx60E9PZQ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ddx60E9PZQ1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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