Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ryr1E9PZQ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ryr1E9PZQ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms