Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms