Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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