Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms