Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms