Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms