Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms