Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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