Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms