Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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