Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms